A COEPi construiu, ao longo de três décadas, uma rede de parcerias institucionais que a conecta aos três níveis do poder público, a organismos internacionais, a universidades e a organizações da sociedade civil. Entre os principais parceiros com quem a instituição mantém ou manteve relação estruturante destacam-se:
- Ministério da Cultura (MinC) — Ponto de Cultura desde 2004, Pontão de Articulação (2010–2013), Escola Livre de Arte e Cultura desde 2025.
- Secretaria de Estado da Cultura de Goiás — editais FAC/GO recorrentes; LAB (2020/2021), Lei Paulo Gustavo (2022/2023); PNAB GO (2024/2025).
- Prefeitura Municipal de Pirenópolis — Secretaria Municipal de Educação (Programa Mais Educação, capacitação de professores); Conselhos Municipais de Cultura, da Criança e do Adolescente e de Educação.
- IBAMA / CETAS-GO — Centro de Educação Ambiental (2004) e capacitações de multiplicadores.
- Ministério do Meio Ambiente — Sala Verde (biblioteca ambiental); Circuito Tela Verde.
- IBRAM — Instituto Brasileiro de Museus — Museu Oca da Terra (relógio solar, aquisições, formação de monitores, 2021).
- FUNARTE — Prêmio Interações Estéticas nas edições 2008, 2009, 2010 e 2013.
- Fundo Itaú de Excelência Social (PIPS FIES 2010) — construção do Museu Oca da Terra e tecnologias sociais de biorremediação e manejo de água.
- Itaú Social / Itaú-Unicef — finalista e semifinalista em duas edições do prêmio nacional, na categoria Micro Porte.
- Fundo Casa Socioambiental — apoio à Brigada Gavião Fumaça (drone, geoprocessamento, PMIF) em 4 projetos.
- FunBio — apoio ao Seminário de Gestão Integrada das Unidades de Conservação da Serra dos Pireneus (2025).
- WWF-Brasil — Programa Água Brasil (2014, 2015); capacitações em Consumo Responsável e Coleta Seletiva.
- EMBRAPA-Cerrados, EMBRAPA-Hortaliças e EMATER-DF — oficinas de agroecologia em parceria (2019).
- Fundação Banco do Brasil / FBB — Programa Água Brasil.
- Embaixada da Nova Zelândia — estufa agrícola metálica de alta tecnologia e modernização da Área Demonstrativa de Agroecologia (2019).
- Universidade Estadual de Goiás (UEG) e Universidade Federal de Goiás (UFG) — visitas de estudantes, professores, mesas redondas, parcerias em pesquisa.
- Escola Municipal Dom Emmanoel Gomes de Oliveira — parceria contínua desde 2013 em programas de contraturno, educação patrimonial e Mais Educação.
- SERPRO — Telecentro da COEPi (doação de computadores em 2001 e revitalização em 2009) Funcionou até 2012.
- SENAR/GO e Sindicato Rural de Pirenópolis — treinamento em cultivo orgânico de plantas medicinais (2012).
- Instituto Cerrados — Seminário de Gestão Integrada das UCs da Serra dos Pireneus (2025).
- Associação de Atrativos Turísticos de Pirenópolis e Região da Serra dos Pireneus — doações à Brigada Gavião Fumaça (2023).